离职时签保密协议合法，但需经济补偿。依据《劳动合同法》，保密协议可约定在劳动合同中或单独签订，若无经济补偿则无效。不及时处理可能导致协议无效，无法保护商业秘密。
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处理保密协议的方式有接受或拒绝。若协议内容合理且有经济补偿，可选择接受；若无经济补偿或条款不合理，可拒绝签订并协商修改。
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离职签保密协议需谨慎。操作如下：1.查看协议是否有经济补偿，无则提出异议；2.确认保密内容是否合理，不合理部分需协商修改；3.如协议合法合规，双方签字确认并留存备份。